益生菌是在适量摄入时对宿主（人类）健康有益的活性微生物，主要功能是改善宿主的微生态平衡。益生菌是儿科临床最常用的微生态制剂，具有维持或调节微生态平衡、防治疾病和增进宿主健康的作用。临床用于肠菌群失调引起的肠功能紊乱，如急、慢性腹泻、便秘等。使用微生态制剂需注意以下几点：
一、贮存方法：2℃～8℃避光保存。活菌在0-4℃处于“休眠期”，繁殖速度较慢，但菌体有活性。随着环境温度升高，菌体就会快速繁殖、死亡，疗效降低。
二、使用方法：温开水送服。益生菌为活菌体，热水能杀死活菌，所以益生菌散剂（如双歧杆菌二联活菌）用凉开水冲服，片剂或胶囊剂可用50℃以下水或牛奶送服。
三、食物的影响：饭后服用。益生菌应避免空腹服用，因为空腹胃酸分泌较多，胃酸可能破坏益生菌的活性，降低药效；饭后服用胃酸被食物中和，对益生菌药性影响较小。
四、注意抗菌药物的相互作用：氯霉素、红霉素、头孢菌素、青霉素对活菌有抑制作用。对抗菌药物敏感的益生菌（如双歧杆菌属、乳酸杆菌、肠球菌属、链球菌属等）应避免与抗菌药物同时服用，如需联合使用时，应间隔2小时以上；对抗菌药物不敏感的益生菌（布拉氏酵母菌、酪酸梭菌和芽孢杆菌）可以同时使用。
五、注意蒙脱石散的相互作用：先服用蒙脱石散、2h使用益生菌。蒙脱石散可选择性固定、吸附消化系统疾病患儿的病原微生物而发挥治疗作用，2h后再服用微生态制剂促使其在肠粘膜上定植，帮助恢复肠道的菌群平衡。
六、注意其他药物对益生菌的影响：铋剂、鞣酸、药用炭、酊剂等能抑制、吸附或杀灭活菌，不应和活菌制剂联合应用。
七、如患者正在服用其他药品，自行购买益生菌制剂前请咨询医师或药师。